Изучение экспрессии гена Orthopedia homeobox в различных опухолевых и нормальных тканях человека
PDF

Ключевые слова

опухолеспецифическая экспрессия
Orthopedia homeobox (ОТР)
опухолевые маркеры
диагностика онкологических заболеваний

Аннотация

Изучена экспрессия гена ОТР в различных нормальных и опухолевых тканях человека методом ПЦР со специфическими праймерами. Ген ОТР экспрессируется в 23 из 29 опухолевых образцов, а интронный фрагмент гена ОТР (последовательность AI267901) в 49 из 59 опухолевых образцов различных локализаций. Изучаемые нами фрагменты гена ОТР практически не транскрибируются в нормальных и эмбриональных тканях за исключением нормальной ткани яичка, то есть могут быть отнесены к категории раково-тестикулярных транскриптов. по предварительным данным РНК AI267901 и мРНк гена ОТР транскрибируются с разных нитей ДНК. Таким образом, с локуса гена ОТР получается два независимых опухолеспецифических транскрипта, являющихся потенциальными маркерами для диагностики онкологических заболеваний.
https://doi.org/10.18722/VO2017631128-134
PDF

Литература

Baranova A.V., Lobashev A.V., Ivanov D.V. et al. In silico screening for tumour-specific expressed sequences in human genome // FEBS Lett. - 2001. - Vol. 508. - № I. - P. 143-148.

Chirgwin J.M., Przybyla A.E., MacDonald R.J., Rutter W.J. Isolation of biologically active ribonucleic acid from sources enriched in ribonuclease // Biochemistry. - 1979. - V. 18. - № 24. - P. 5294-5299.

Joe W. Gray, Colin Collins. Genome changes and gene expression in human solid tumors // Carcinogenesis. - 2000. - Vol. 21. - № 3. - P. 443-452.

Kim MS, Lee J, Oh T, Moon Y., Chang E, et al. Genome-wide identification of OTP gene as a novel methylation marker of breast cancer // Oncol Rep. - 2012. - Vol. 27. - P. 1681-1688.

Kozlov A.P. Expression of evolutionarily novel genes in Tumors // Infectious Agents and Cancer. - 2016. - Vol. II. - № 34. - DOI 10.1186/s13027-016-0077-6.

Krukovskaja L.L., Baranova A., Tyezelova T. et al. Experimental study of human expressed sequences newly identified in silico as tumor specific // Tumour Biol.-2005. - V. 26. - № 1. - P. 17-24.

Lin X., State M.W., Vaccarino F.M., Greally J., Hass M., Leckman J.F. Identification, chromosomal assignment, and expression analysis of the human homeodomain-containing gene Orthopedia (OTP) // Genomics. - 1999. - Vol. 60. - № 1. - P. 96-104.

Nonaka D., Papaxoinis G., Mansoor W. Diagnostic Utility of Orthopedia Homeobox (OTP) in Pulmonary Carcinoid Tumors // Am J Surg Pathol. - 2016. - Vol. 40. - № 6. - P. 738-744.

Sambrook J., Russel D.W. Molecular cloning: a laboratory manual. 3rd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 2001.

Swarts D.R., Henfling M.E., Van Neste L. et al. CD44 and OTP Are Strong Prognostic Markers for Pulmonary Carcinoids // Clinical Cancer Research. - 2013. - Vol. 19. - P. 2197-2207.

Лицензия Creative Commons

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.