卷 63 期 1 (2017), ORIGINAL ARTICLES. EXPERIMENTAL RESEARCH
卷 63 期 1 (2017)

ИЗУЧЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА ORTHOPEDIA HOMEOBOX В РАЗЛИЧНЫХ ОПУХОЛЕВЫХ И НОРМАЛЬНЫХ ТКАНЯХ ЧЕЛОВЕКА

ORIGINAL ARTICLES. EXPERIMENTAL RESEARCH
https://doi.org/10.37469/0507-3758-2017-63-1-128-134
已出版 2017-01-01
Юлия Карнаухова
Биомедицинский центр, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого
Дмитрий Полев
Биомедицинский центр, Санкт-Петербургский государственный университет
Лариса Круковская
Биомедицинский центр, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого
Андрей Козлов
Биомедицинский центр, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого

摘要

Изучена экспрессия гена ОТР в различных нормальных и опухолевых тканях человека методом ПЦР со специфическими праймерами. Ген ОТР экспрессируется в 23 из 29 опухолевых образцов, а интронный фрагмент гена ОТР (последовательность AI267901) в 49 из 59 опухолевых образцов различных локализаций. Изучаемые нами фрагменты гена ОТР практически не транскрибируются в нормальных и эмбриональных тканях за исключением нормальной ткани яичка, то есть могут быть отнесены к категории раково-тестикулярных транскриптов. по предварительным данным РНК AI267901 и мРНК гена ОТР транскрибируются с разных нитей ДНК. Таким образом, с локуса гена ОТР получается два независимых опухолеспецифических транскрипта, являющихся потенциальными маркерами для диагностики онкологических заболеваний.

PDF (俄语)

参考

Baranova A.V., Lobashev A.V., Ivanov D.V. et al. In silico screening for tumour-specific expressed sequences in human genome // FEBS Lett. - 2001. - Vol. 508. - № I. - P. 143-148.

Chirgwin J.M., Przybyla A.E., MacDonald R.J., Rutter W.J. Isolation of biologically active ribonucleic acid from sources enriched in ribonuclease // Biochemistry. - 1979. - V. 18. - № 24. - P. 5294-5299.

Joe W. Gray, Colin Collins. Genome changes and gene expression in human solid tumors // Carcinogenesis. - 2000. - Vol. 21. - № 3. - P. 443-452.

Kim MS, Lee J, Oh T, Moon Y., Chang E, et al. Genome-wide identification of OTP gene as a novel methylation marker of breast cancer // Oncol Rep. - 2012. - Vol. 27. - P. 1681-1688.

Kozlov A.P. Expression of evolutionarily novel genes in Tumors // Infectious Agents and Cancer. - 2016. - Vol. II. - № 34. - DOI: 10.1186/s13027-016-0077-6

Krukovskaja L.L., Baranova A., Tyezelova T. et al. Experimental study of human expressed sequences newly identified in silico as tumor specific // Tumour Biol.-2005. - V. 26. - № 1. - P. 17-24.

Lin X., State M.W., Vaccarino F.M., Greally J., Hass M., Leckman J.F. Identification, chromosomal assignment, and expression analysis of the human homeodomain-containing gene Orthopedia (OTP) // Genomics. - 1999. - Vol. 60. - № 1. - P. 96-104.

Nonaka D., Papaxoinis G., Mansoor W. Diagnostic Utility of Orthopedia Homeobox (OTP) in Pulmonary Carcinoid Tumors // Am J Surg Pathol. - 2016. - Vol. 40. - № 6. - P. 738-744.

Sambrook J., Russel D.W. Molecular cloning: a laboratory manual. 3rd ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 2001.

Swarts D.R., Henfling M.E., Van Neste L. et al. CD44 and OTP Are Strong Prognostic Markers for Pulmonary Carcinoids // Clinical Cancer Research. - 2013. - Vol. 19. - P. 2197-2207.

##submission.license.cc.by-nc-nd4.footer##

##submission.copyrightStatement##