Role of extracellular DNA in the appearance and development of malignant tumors and possibilities of its use in the diagnosis and treatment of cancer
##article.numberofdownloads## 54
##article.numberofviews## 118
PDF (Русский)

Keywords

внеклеточная ДНК
секвенирование
апоптоз
диагностика и лечение злокачественных опухолей

How to Cite

, & . (2013). Role of extracellular DNA in the appearance and development of malignant tumors and possibilities of its use in the diagnosis and treatment of cancer. Voprosy Onkologii, 59(6), 673–681. https://doi.org/10.37469/0507-3758-2013-59-6-673-681

Abstract

Рассматриваются функции внДНК при опухолевом процессе, результаты секвенирования и диагностичекое значение внДНК при онкологических заболеваниях, изменения внДНК при лечении злокачественных опухолей. Приведены примеры определения модифицированных онкоспецифических последовательностей внДНК в клинических целях для диагностики злокачественных новообразований некоторых локализаций. Оценка внДНК может стать информативным молекулярно-биологическим маркером в диагностике и лечении онкологических заболеваний.
https://doi.org/10.37469/0507-3758-2013-59-6-673-681
##article.numberofdownloads## 54
##article.numberofviews## 118
PDF (Русский)

References

Беспалов В.Г., Жабин А.А., Стуков А.Н. и др. Синергизм противоопухолевого действия диоксадэта и цисплатина на модели асцитной опухоли яичника // Сиб. онкол. журнал. — 2013. — № 1. — С. 42-46.

Васильева И.Н. Внеклеточная низкомолекулярная ДНК крови в диагностике и лечении различных заболеваний // Медлайн экспресс. — 2013. — № 1. — С. 73-79.

Васильева И.Н., Ивчик Т.В., Вознюк И.А. Роль низкомолекулярной фракции ДНК в диагностике патологического процесса при радиационном поражении и некоторых заболеваниях // Мол. медицина. — 2011. — № 5. — С. 132-135.

Ермаков А.В., Костюк С.В., Еголина Н.А. и др. Сигнализация между лимфоцитами человека после индукции эффекта свидетеля воздействием ионизирующей радиации в адаптирующих дозах // Радиац. биол. Радиоэкол. — 2007. — Т. 47, № 6. — С. 650-657.

Зарецкий А.Р., Рогожина Е.М., Дрозд О.В. и др. Анализ мутаций в генах ras-каскада для диагностики, мониторинга и подбора терапии при некоторых видах злокачественных опухолей: диагностический потенциал и методические особенности // Молекулярная диагностика-2010: Сборник трудов VII Всерос. научно-практ. конф. / Под ред. В.И. Покровского. — М., 2010. — Т. 4. — С. 66-72.

Зеленкова Н.К., Белохвостов А.С., Липова В.А. и др. Нуклеиновый фактор в асцитической жидкости при опухолях яичника человека // Вопр. онкол. — 1980. — Т. 26, № 8. — С. 45-48.

Зинкин В.Н., Васильева И.Н., Вознюк И.А. Определение внеклеточной низкомолекулярной ДНК в крови как диагностический метод для клинических и экспериментальных исследований // Авиакосм. и экол. мед. — 2011. — Т. 45, № 5. — С. 47-51.

Стуков А.Н., Гершанович М.Л., Беспалов В.Г. и др. Классификация противоопухолевых препаратов // Медлайн экспресс. — 2012. — № 2. — С. 20-24.

Тамкович С.Н., Брызгунова О.Е., Рыкова Е.Ю. и др. Циркулирующие нуклеиновые кислоты в крови больных раком желудка и толстой кишки // Биомед. химия. — 2005. — Т. 51, № 3. — С. 321-328.

Тамкович С.Н., Лактионов П.П., Брызгунова О.Е. и др. Уровень внеклеточных нуклеиновых кислот, связанных с поверхностью форменных элементов крови, в диагностике рака молочной железы // Мол. медицина. — 2005. — № 2. — С. 46-50.

Adams D.H., Diaz N., Gahan P.B. In vitro stimulation by tumour cell media of [3H]-thymidine incorporation by mouse spleen lymphocytes // Cell Biochem. Funct. — 1997. — Vol. 15. — P. 119-126.

Anker P., Lyautey J., Lefort F. et al. Transformation of NIH/3T3 cells and SW 480 cells displaying K-ras mutation //CR Acad Sci III. — 1994. — Vol. 317. — P. 869-874.

Anker P., Stroun M. Circulating nucleic acids and evolution // Expert Opin. Biol. Th er. — 2012. — Vol. 12 (Suppl. 1). — P. 113-117.

Anker P., Stroun M., Maurice P.A. Spontaneous release of DNA by human blood lymphocytes as shown an in vitro system // Cancer Res. — 1975. — Vol. 35. — P. 23752382.

Beck J., Urnovitz H.B., Riggert J. et al. Profile of the circulating DNA in apparently healthy individuals // Clin. Chem. — 2009. — Vol. 55. — P 730-738.

Belokhvostov A.S., Zelenkova N.K. Low-molecular weight nucleic acids in the blood of rats Zajdela’s hepatoma // Cancer Lett. — 1978. — Vol. 5. — P. 351-356.

Cabral R.E.C., Cabral Neto J.B., Costa Carvalho M.G. Circulating DNA as a biomarker for early detection of cancer: a brief update with an emphasis on lung cancer // Open Lung Cancer J. — 2010. — Vol. 3. — P. 38-44.

Casadio V., Calistry D., Salvi S. et al. Urine cell-free DNA integrity as a marker for early prostate cancer diagnosis: a pilot study // Biomed. Res. Int. — 2013. — Vol. 2013. — Article Id 270457.

Cherepanova A.V., Bushuev A.V., Duzhak T.G. et al. Ku protein as the main cellular target of cell-surface-bound circulating DNA// Expert Opin. Biol. Ther. — 2012. — Vol. 12 (Suppl. 1). — P. 35-41.

Cherepanova A.V., Bushuev A.V., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Cell-surface-bound DNA inhibits poly (I:C)-activated IL-6 and IL-8 production in human primary endothelial cells and fibroblasts // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by P.B. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 207-211.

Chorbian S., Ardekani A.M. Non-invasive detection of esophageal cancer using genetic changes in circulating cell-free DNA // Avicenna J. Med. Biotechnol. — 2012. — Vol. 4. — P. 3-13.

DeVos T., Tetzner R., Model F. et al. Circulating methylated SEPT9 DNA in plasma is a biomarker for colorectal cancer // Clin. Chem. — 2009. — Vol. 55. — P. 13371346.

Diehl F., Li M., Dressman D. et al. Detection and quantification of mutants in the plasma of patients with colorectal tumors // Proc. Natl Acad. Sci. USA. — 2005. — Vol. 102. — P. 16368-16373.

Dobrzycka B., Terlicowski S.J., Kinalski M. et al. Circulating free DNA and p53 antibodies in plasma of patients with ovarian epithelial cancers // Ann. Oncol. — 2011. — Vol. 22. — P. 1133-1140.

Fan H.C., Blumenfeld Y.J., Chitkara U. et al. Noninvasive diagnosis of fetal aneuploidy by shotgun sequencing DNA from maternal blood // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2008. — V. 105. — P. 16266-16271.

Fehr Y, Holdenrieder S., Hoffman R.T. et al. Circulating nucleosomes in cancer patients with liver metastases undergoing selective internal radiation therapy using Yttrium-90 labelled microspheres // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by PB. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 91-96.

Fleischhaker M., Schmidt B. Circulating nucleic acids (CNAs) and cancer — a survey // Biochim. Biophis. Acta. — 2007. — Vol. 1775. — P. 181-232.

Gahan P.B. Biology of circulating nucleic acids and possible roles in diagnosis and treatment in diabetes and cancer // Infect. Disord. Drug Targets. — 2012. — Vol. 12. — P. 360-370.

Gahan P.B., Stroun M. The virtosome — a novel cytosolic informative entity and intercellular messenger // Cell Biochem. Funct. — 2010. — Vol. 28. — P. 529-538.

Garcia-Olmo D., Garcia-Olmo D.C., Ontanon J. et al. Tumor DNA circulating in the plasma might play a role in metastasis. The hypothesis of the genometastasis // Histol. Histopatol. — 1999. — Vol. 14. — P. 1159-1164.

Garcia-Olmo D.C., Dominguez C., Garcia-Arranz M. et al. Cell-free nucleic acids circulating in the plasma of colorectal cancer patients induce the oncogenic transformation of susceptible cultured cells // Cancer Res. — 2010. — Vol. 70. — P. 560-567.

Garcia-Olmo D.C., Picazo M.G., Toboso I. et al. Quantitation of cell-free DNA and RNA in plasma during tumor progression in rats // Mol. Cancer. — 2013. — Vol. 12:8.

Holdenrieder S., Stiber P. Clinical use of circulating nucleosomes // Crit. Rev. Clin. Lab. Sci. — 2009. — Vol. 46. — P. 1-24.

Kohles N., Nagel D., Jungst D. et al. The course of circulating nucleosomes in liver cancer patients undergoing transarterial chemoembolization therapy // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by P.B. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 73-78.

Korshunova Y, Maloney R.K., Lakey N. et al. Massive parallel bisulphate pyrosequencing reveals the molecular complexity of breast cancer-associated cytosine-methylation patterns obtained from tissue and serum DNA // Genome Res. — 2008. — Vol. 18. — P. 19-29.

Kostyuk S.V., Ermakov A.V., Alekseeva A.Y et al. Role of extracellular DNA oxidative modification in radiation induced bystander effects in human endotheliocytes // Mutat. Res. — 2012. — Vol. 729. — P. 52-60.

Kuhlmann J.D., Schwarzenbach H., Wimberger P. et al. LOH at 6q and 10q in fractionated circulating DNA of ovarian cancer patients is predictive for tumor cell spread and overall survival // BMC Cancer. — 2012. — Vol. 12:325.

Lander E.S., Linton L.M., Birren B. et al. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. — 2001. — Vol. 409. — P. 860-921.

Lehner J., Stötzer O.J., Ferschibg D.M. et al. Plasma DNA integrity indicates response to neoadjuvant chemotherapy in patients with locally confined breast cancer // Int. J. Clin. Pharm. Ther. — 2013. — Vol. 51. — P. 59-62.

Lo Y.M., Zhang J., Leung T.N. et al. Rapid clearance of fetal DNA from maternal plasma // Am. J. Hum. Genet. — 1999. — Vol. 64. — P 218-224.

Morozkin E.S., Loseva E.M., Morozov I.V. et al. A comparative study of cell-free apoptotic and genomic DNA using FISH and massive parallel sequencing // Expert Opin. Biol. Ther. — 2012. — Vol. 12 (Suppl. 1). — P. 11-17.

Murtaza M., Dawson S.J., Dana W.Y et al. Non-invasive analysis of acquired resistance to cancer therapy by sequencing of plasma DNA // Nature. — 2013. — Vol. 497. — P. 108-112.

Ponomareva A.A., Rykova E.Y, Cherdyntseva N.A. et al. Concentration and distribution of single-copy ß-actin gene and LINE-1 repetitive elements in blood of lung cancer patients // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by PB. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 41-45.

Serrano-Heras G., Garcia-Olmo D., Garcia-Olmo D.C. Microvesicles circulating in plasma of rats contain DNA. Are these small vesicles a main sours of cell-free DNA in plasma? // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by PB. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 234-244.

Shinozaki M., O’Day S.J., Kitago M. Utility of circulating B-RAF DNA mutation in serum for monitoring melanoma patients receiving biochemotherapy // Clin. Cancer Res. — 2007. — Vol. 13. — P. 2068-2074.

Stroun M., Anker P, Lyautey J. et.al. Isolation and characterization of DNA from the plasma of cancer patients // Eur. J. Cancer Clin. Oncol. — 1987. — Vol. 23. — P. 707-712.

Stroun M., Lyautey J., Lederrey C. et al. Alu repeat sequences are present in increased proportions compared to a unique gene in plasma/serum DNA: evidence for a preferential release from viable cells? // Ann. N.Y Acad. Sci. — 2001. — Vol. 945. — P. 258-264.

Tamkovich S.N., Cherepanova A.V., Kolesnikova E.V. et al. Circulating DNA and DNase activity in human blood // Ann. N.Y Acad. Sci. — 2006. — Vol. 1075. — P. 191-196.

Thompson C.B. Apoptosis in the pathogenesis and treatment of disease // Science. — 1995. — Vol. 267. — P. 1456-1462.

Tillo D., Hughes T.R. G+C content dominates intrinsic nucleosome occupancy // BMC Bioinformatics. — 2009. — Vol. 10:442

Trejo-Becerril C., Perez-Cardenas E., Taja-Chayeb L. et al. Cancer progression mediated by horizontal gene transfer in an in vivo model // PLoS One. — 2012. — Vol. 7:e52754.

Van der Vaart M., Semenov D.V., Kuligina E.V. et al. Advanced analysis of human plasma circulating DNA sequence produced by parallel tagged sequencing on the 454 platform // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. by PB. Gahan. — Dordrecht, Heidelberg, London, New York: Springer, 2011. — P. 35-40.

Van Helden P.D. Potential Z-DNA-forming elements in serum DNA from human systemic lupus erythematosus // J. Immunol. — 1985. — Vol. 134. — P. 177-179.

Vasilyeva I.N. Low-molecular-weight DNA in blood plasma as an index of the influence of ionizing radiation // Ann. N.Y Acad. Sci. — 2001. — Vol. 945. — P. 221-228.

Vasilyeva I.N., Zinkin V.N. The value of blood plasma low-molecular-weight DNA for diagnostics of pathological processes of different genesis // Biochemistry Suppl. Ser. B: Biomed. Chem. — 2012. — Vol. 6, No. 3. — P. 278-287.

Vasioukhin V., Anker P, Maurice P et al. Point mutations of the N-ras gene in the blood plasma DNA of patients with myelodysplastic syndrome or acute myelogenous leukaemia // Br. J. Haematol. — 1994. — Vol. 86. — P. 774-779.

Vladimirov V.G., Belokhvostov A.S., Sherlina S.S. et al. Extracellular DNA level in the blood of irradiated rats // Int. J. Radiat. Biol. — 1992. — Vol. 62. — P 667-671.

Zaichik A.Sh., Churilov L.P, Utekhin V.J. Autoimmune regulation of genetically determined cell functions in health and disease // Pathophysiology. — 2008. — Vol. 15. — P. 191-207.

All the Copyright statements for authors are present in the standart Publishing Agreement (Public Offer) to Publish an Article in an Academic Periodical 'Problems in oncology' ...