Межлабораторный контроль качества тестирования мутаций в гене BRAF: опыт Межрегиональной общественной организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии (МОО ОМГО)

Демидова, И. А., Алексахина, С. Н., Друй, А. Е., Кекеева, Т. В., Мартьянов, А. С., Третьякова, Я. И., Фирсова, Н. А., Филипенко, М. Л., Цаур, Г. А., Цуканов, А. С., & Имянитов, Е. Н. (2025). Межлабораторный контроль качества тестирования мутаций в гене BRAF: опыт Межрегиональной общественной организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии (МОО ОМГО). VOPROSY ONKOLOGII, 71(6), OF–2485. https://doi.org/10.37469/0507-3758-2025-71-6-OF-2485

摘要

Введение. Опухоли, содержащие мутацию в кодоне 600 гена BRAF, демонстрируют чувствительность к ингибиторам BRAF-киназы. Молекулярно-генетическое тестирование данного гена является неотъемлемым компонентом диагностических мероприятий, применяемых в отношении меланом кожи, карцином толстой кишки, легкого, щитовидной железы, а также некоторых других разновидностей опухолей. Частота мутаций BRAF, наблюдаемая у российских пациентов с меланомой кожи, по данным различных публикаций, колеблется от 28 до 60 % — это указывает на высокую вероятность межлабораторных вариаций в процедуре тестирования.

Цель. Оценка качества тестирования мутаций BRAF в различных лабораториях.

Материалы и методы. Для организации контроля качества определения BRAF-статуса в меланомах была подготовлена панель из 15 образцов опухолей, которые продемонстрировали идентичные результаты молекулярно-генетического анализа в двух референсных лабораториях Межрегиональной общественной организации молекулярных генетиков в онкологии и онкогематологии (МОО ОМГО).

Результаты. Панель была предложена 13 лабораториям, которые выразили предварительный интерес к участию в данном проекте. 10 лабораторий подтвердили согласие принять образцы в работу, четыре из которых продемонстрировали удовлетворительные результаты тестирования: одна лаборатория правильно определила статус BRAF во всех предоставленных образцах и три лаборатории ошиблись в одном из тестов. Не было зафиксировано ни одного ложноположительного результата. К основным причинам неудовлетворительных итогов относились несоблюдение заранее оговоренного двухнедельного срока тестирования (две лаборатории), три и более ложноотрицательных результата (три лаборатории) и отказ принять в работу более половины образцов вследствие недоступности процедуры диссекции опухолевых клеток (одна лаборатория).

Выводы. По итогам данной инициативы, можно сделать вывод о наличии существенных межлабораторных вариаций в отношении качества молекулярно-генетических исследований. Необходимы дальнейшие усилия, которые позволят снизить риск ошибок при тестировании биологического материала на предмет наличия мутаций.

https://doi.org/10.37469/0507-3758-2025-71-6-OF-2485

##article.numberofdownloads## 0

##article.numberofviews## 1

pdf (Русский)

参考

Davies H., Bignell G.R., Cox C., et al. Mutations of the BRAF gene in human cancer. Nature. 2002; 417(6892): 949-54.-DOI: https://doi.org/10.1038/nature00766.

Roa P., Bremer N.V., Foglizzo V., Cocco E. Mutations in the serine/threonine kinase BRAF: oncogenic drivers in solid tumors. Cancers (Basel). 2024; 16(6): 1215.-DOI: https://doi.org/10.3390/cancers16061215.

Halle B.R., Johnson D.B. Defining and targeting BRAF mutations in solid tumors. Curr Treat Options Oncol. 2021; 22(4): 30.-DOI: https://doi.org/10.1007/s11864-021-00827-2.

Gouda M.A., Subbiah V. Precision oncology for BRAF-mutant cancers with BRAF and MEK inhibitors: from melanoma to tissue-agnostic therapy. ESMO Open. 2023; 8(2): 100788.-DOI: https://doi.org/10.1016/j.esmoop.2023.100788.

Aleksakhina S.N., Ivantsov A.O., Imyanitov E.N. Agnostic Administration of targeted anticancer drugs: Looking for a balance between hype and caution. Int J Mol Sci. 2024; 25(7): 4094.-DOI: https://doi.org/10.3390/ijms25074094.

Imyanitov E.N., Mitiushkina N.V., Kuligina E.S., et al. Pathways and targeting avenues of BRAF in non-small cell lung cancer. Expert Opin Ther Targets. 2024; 28(7): 613-622.-DOI: https://doi.org/10.1080/14728222.2024.2374742.

Heinzerling L., Kühnapfel S., Meckbach D., et al. Rare BRAF mutations in melanoma patients: implications for molecular testing in clinical practice. Br J Cancer. 2013; 108(10): 2164-71.-DOI: https://doi.org/10.1038/bjc.2013.143.

Qu K., Pan Q., Zhang X., et al. Detection of BRAF V600 mutations in metastatic melanoma: comparison of the Cobas 4800 and Sanger sequencing assays. J Mol Diagn. 2013; 15(6): 790-5.-DOI: https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2013.07.003.

Bauer J., Büttner P., Murali R., et al. BRAF mutations in cutaneous melanoma are independently associated with age, anatomic site of the primary tumor, and the degree of solar elastosis at the primary tumor site. Pigment Cell Melanoma Res. 2011; 24(2): 345-51.-DOI: https://doi.org/10.1111/j.1755-148X.2011.00837.x.

Frank G.A., Aleksakhina S.N., Zavalishina L.E., et al. BRAF and NRAS mutations In Russian melanoma patients: results of a nationwide study. Melanoma Res. 2016; 26(5): 442-7.-DOI: https://doi.org/10.1097/CMR.0000000000000278.

Кит О.И., Водолажский Д.И., Ефимова И.Ю., et al. Связь клинико-морфологических особенностей и мутационного статуса гена BRAF в качестве прогностического фактора у больных меланомой кожи. Медицинская генетика. 2016; 15(6): 19-24. [Kit O.I., Vodolazhsky D.I., Efimova I.Yu., et al. Relationship of clinical and morphological features and mutational status of the BRAF gene as a prognostic factor in patients with skin melanoma. Medical Genetics. 2016; 15(6): 19-24 (In Rus)].

Орлова К.В., Демидов Л.В. Распространенность различных подтипов мутации в гене BRAF у пациентов с метастатической меланомой в России на основании собственных исследований. Эффективная фармакотерапия. 2024; 20(22): 38-40.-DOI: https://doi.org/10.33978/2307-3586-2024-20-22-38-40. [Orlova K.V., Demidov L.V. Prevalence of various subtypes of mutation in the BRAF gene in patients with metastatic melanoma In Russia based on their own research. Effective Pharmacotherapy. 2024; 20(22): 38-40.-DOI: https://doi.org/10.33978/2307-3586-2024-20-22-38-40 (In Rus)].

Титов К.С., Сорокина М.В., Лебедев С.С., et al. Взаимосвязь клинико-морфологических параметров с BRAF-статусом опухоли у пациентов с меланомой кожи I стадии. Вестник медицинского института «РЕА-ВИЗ»: Реабилитация, Врач и Здоровье. 2024; 14(3): 74-82.-URL: https://doi.org/10.20340/vmi-rvz.2024.3.CLIN.2. [Titov K.S., Sorokina M.V., Lebedev S.S., et al. The relationship of clinical and morphological parameters with the BRAF status of the tumor in patients with stage I skin melanoma. Bulletin of the Medical Institute REAVIZ (Rehabilitation, Doctor and Health). 2024; 14(3): 74-82.-DOI: https://doi.org/10.20340/vmi-rvz.2024.3.CLIN.2 (In Rus)].

Каприн А.Д., Старинский В.В., Шахзадова А.О. Злокачественные новообразования в России в 2023 году (заболеваемость и смертность). Под ред. Каприна А.Д., Старинского В.В., Шахзадовой А.О. М.: МНИОИ им. П.А. Герцена — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России. 2024; 276. [Kaprin A.D., Starinsky V.V., Shakhzadova A.O., Malignant neoplasms In Russia in 2023 (morbidity and mortality). Ed. by Kaprina A.D., Starinsky V.V., Shakhzadova A.O. Moscow: P.A. Herzen Moscow State Medical Research Institute — branch of the Federal State Budgetary Institution ‘NMRC of Radiology’ of the Ministry of Health of Russia. 2024; 276 (In Rus)].

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Most read articles by the same author(s)

Гульфия Мидхатовна Телетаева, Екатерина Александровна Дегтярёва, Татьяна Юрьевна Семиглазова, Лилия Сергеевна Бабошкина, Евгений Наумович Имянитов, Современные подходы к лечению KRAS-мутированного метастатического колоректального рака: обзор литературы , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 71 编号 2 (2025)
Владимир Федорович Семиглазов, Петр Владимирович Криворотько, Татьяна Юрьевна Семиглазова, Елена Владимировна Артамонова, Анна Сергеевна Артемьева, Светлана Геннадьевна Багрова, Лариса Владимировна Болотина, Елена Михайловна Бит-Сава, Алла Александровна Божок, Любовь Юрьевна Владимирова, Вера Андреевна Горбунова, Айкуи Карапетовна Геокчян-Кждрян, Наталья Владимировна Деньгина, Людмила Григорьевна Жукова, Азиз Дильшодович Закиряходжаев, Евгений Наумович Имянитов, Ирина Владимировна Колядина, Ирина Альбертовна Королева, Асель Галимовна Кудайбергенова, Алексей Георгиевич Манихас, Сергей Николаевич Новиков, Рашида Вахидовна Орлова, Руслан Маликович Палтуев, Александр Валерьевич Петровский, Анастасия Анатольевна Пароконная, Сергей Михайлович Портной, Григорий Александрович Раскин, Валерий Витальевич Родионов, Никита Александрович Савелов, Владислав Владимирович Семиглазов, Марина Борисовна Стенина, Калдыгуль Кабаковна Смагулова, Даниил Львович Строяковский, Эльдар Эскендерович Топузов, Оксана Петровна Трофимова, Мона Александровна Фролова, Ольга Сергеевна Ходорович, Юлиана Сергеевна Шатова, I Cанкт-Петербургский международный консенсус по диагностике и лечению рака молочной железы «Белые ночи 2024» , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 6 (2024)
Лилия Сергеевна Бабошкина, Светлана Анатольевна Проценко, Алексей Викторович Новик, Дилором Хамидовна Латипова, Кристина Юрьевна Капуста, Денис Львович Стрекалов, Анна Игоревна Семенова, Гульфия Мидхатовна Телетаева, Татьяна Юрьевна Семиглазова, Евгений Наумович Имянитов, Новые терапевтические подходы для опухолей с мутациями генов семейства RAS (клиническое исследование NТО-RAS) , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 5 (2024)
Азат Инзирович Муртазин, Светлана Николаевна Алексахина, Анна Дмитриевна Шестакова, Евгений Владимирович Левченко, Евгений Наумович Имянитов, Перспективы таргетной терапии KRAS-мутированных карцином легкого , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 6 (2024)
Анна Викторовна Агаева, Людмила Евгеньева Валькова, Мария Андреевна Заярная, Елена Федоровна Потехина, Дмитрий Васильевич Богданов, Евгений Наумович Имянитов, Михаил Юрьевич Вальков, Прогностическое значение отдельных иммуногистохимических маркеров при раке молочной железы: углубленный эпидемиологический анализ по данным Архангельского регистра рака , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 3 (2024)
Аглая Геннадиевна Иевлева, Светлана Николаевна Алексахина, Анна Петровна Соколенко, Екатерина Андреевна Отраднова, Алиса Сергеевна Никитина, Кира Антоновна Кашко, Мария Вячеславовна Сёмина, Анна Дмитриевна Шестакова, Екатерина Шотовна Кулигина, Александр Викторович Того, Евгений Наумович Имянитов, Спектр мутаций в генах репарации ДНК по механизму гомологичной рекомбинации при раке предстательной железы у российских пациентов , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 71 编号 1 (2025)
Дмитрий Владимирович Михеев, Александра Павловна Чернякова, Наталья Владимировна Митюшкина , Владислав Ильич Тюрин , Алиса Сергеевна Никитина , Каримат Амирхановна Асадулаева , Аглая Геннадиевна Иевлева , Евгений Наумович Имянитов , Распространённость редких мутаций в гене EGFR при немелкоклеточном раке легкого , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 6 (2024)
Екатерина Шотовна Кулигина, Григорий Аркадьевич Янус, Александр Сергеевич Мартьянов, Юлий Андреевич Горгуль, Екатерина Олеговна Степанова, Федор Владимирович Моисеенко, Евгений Наумович Имянитов, Циркулирующие опухолевые ДНК как экспресс-маркер эффективности таргетной и химиотерапии , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 69 编号 5 (2023)
Екатерина Шотовна Кулигина, Юлий Андреевич Горгуль, Григорий Аркадьевич Янус, Софья Владимировна Баскина, Евгения Витальевна Белогубова, Айгуль Рифовна Венина, Алексей Михайлович Беляев, Александр Викторович Того, Евгений Наумович Имянитов, Анна Петровна Соколенко, Наследственный рак молочной железы и яичника: молекулярный патогенез и терапевтические мишени , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 71 编号 2 (2025)
Гульфия Мидхатовна Телетаева, Екатерина Александровна Дегтярёва, Анна Игоревна Семенова, Татьяна Юрьевна Семиглазова, Артур Юрьевич Малыгин, Аглая Геннадиевна Иевлева, Евгений Наумович Имянитов , Молекулярно-генетический профиль колоректального рака: клиническое значение типичных и агностических мутаций , VOPROSY ONKOLOGII: 卷 70 编号 5 (2024)

1 2 3 4 > >>