ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ТАРГЕТНОЙ МУЛЬТИГЕННОЙ ПАНЕЛИ ДЛЯ ПОИСКА ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ НАСЛЕДСТВЕННОГО РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РОССИЙСКИХ ПАЦИЕНТОК
PDF

Ключевые слова

НАСЛЕДСТВЕННЫЙ РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
ТАРГЕТНАЯ МУЛЬТИГЕННАЯ ПАНЕЛЬ

Аннотация

Понимание молекулярно-генетического патогенеза наследственного ракового синдрома чрезвычайно важно для разработки персональных терапевтических подходов и для увеличения эффективности превентивных мер. На данный момент оптимальным решением для диагностики каузативных мутаций наследственного рака молочной железы (РМЖ) является тестирование таргетных мультигенных панелей с помощью высокопроизводительного секвенирования (NGS). Авторы сформировали NGS-панель из 31 гена, основываясь на их потенциальной причастности к формированию онкологической предрасположенности и встречаемости патогенных аллелей в российской популяции. В эту группу вошли «канонические» гены наследственного РМЖ (BRCA1, BRCA2, BRIP1, PALB2, TP53, ATM, NBN), «новые» гены, в которых относительно недавно были идентифицированы каузативные мутации (BLM, fAnCD2, POLE, FANCM, RAD51C, MRE11A, RECQL), а также некоторые другие гены, вовлеченные в репарацию ДНК, апоптоз и поддержание стабильности генома. Был выполнен скрининг мутаций у 94 пациенток с предположительно наследственным РМЖ неизвестной генетической этиологии, отбор пациенток был произведен согласно критериям соответствия наследственным опухолевым синдромам. Применение таргетной панели позволило с высокой долей уверенности назвать генетическую детерминанту заболевания у 21/94 (22,3%) больных, причем у 19 пациенток причиной заболевания были редкие мутации BRCA1 и BRCA2, не относящиеся к российским «фаундер» мутациям, а в оставшихся двух случаях были нарушены функции генов ATM (p.Glu73fs) и POLE (p.Leu1171fs). Данное наблюдение имеет большую клиническую значимость, поскольку является основанием для расширения диагностической панели, нацеленной на мониторинг лиц с повышенным онкологическим риском, и внедрения в клиническую диагностику мультигенного таргетного секвенирования.
https://doi.org/10.37469/0507-3758-2019-65-3-349-356
PDF

Библиографические ссылки

Afghahi A., Kurian W. A. The changing landscape of genetic testing for inherited breast cancer predisposition // Curr. Treat. Options in Oncol. - 2017. - Vol. 18. - P. 27.

Balanovsky O., Rootsi S., Pshenichnov A. et al. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context // Am. J. Hum. Genet. - 2008. - Vol. 82. - P. 236-250.

Chong H.K., Wang T., Lu H-M. et al. The Validation and Clinical Implementation of BRCAplus: A Comprehensive High-Risk Breast Cancer Diagnostic Assay // PLoS ONE. - 2014. - Vol. 9(5). - P. e97408.

Crawford B., Adams S.B., Sittler T. et al. Multi-gene panel testing for hereditary cancer predisposition in unsolved high-risk breast and ovarian cancer patients // Breast Cancer Res Treat. - 2017. - Vol. 163(2). - P. 383-390.

Cybulski C., Carrot-Zhang J., Kluzniak W. et al. Germline RECQL mutations are associated with breast cancer susceptibility // Nat. Genet. - 2015. - Vol. 47. - P 643-646.

Curci A., Capasso I., Romano A. et al. Characterization of 2 novel and 2 recurring BRCA1 germline mutations in breast and/or ovarian carcinoma patients from the area of Naples // Int. J. Oncol. - 2002. - Vol. 20. - № 5. - P. 963-970.

Desmond A., Kurian A.W., Gabree M. et al. Clinical Actionability of Multigene Panel Testing for Hereditary Breast and Ovarian Cancer Risk Assessment // JAMA Oncol. - 2015. - Vol. 1(7). - P 943-951.

Gayther S.A., Harrington P, Russell P et al. Frequently occurring germ-line mutations of the BRCA1 gene in ovarian cancer families from Russia // Am J. Hum Genet. - 1997. - Vol. 60. - № 5. - P. 1239-1242.

Graffeo R., Livraghi L., Pagani O. et al. Time to incorporate germline multigene panel testing into breast and ovarian cancer patient care // Breast Cancer Res Treat. - 2016. - Vol. 160. - P. 393-410.

Hall M.J., Obeid E., Daly M.B. Multigene panels to evaluate hereditary cancer risk: reckless or relevant? // J. Clin. Oncol. - 2016. - Vol. 34. - P. 4186-4187.

Hauke J., Horvath J., GrolS E. et al. Gene panel testing of 5589 BRCA1/2-negative index patients with breast cancer in a routine diagnostic setting: results of the German Consortium for Hereditary Breast and Ovarian Cancer // Cancer Med. - 2018. - Vol. 7(4). - P. 1349-1358.

Hoyer J., Vasileiou G., Uebe S. et al. Addition of triple negativity of breast cancer as an indicator for germline mutations in predisposing genes increases sensitivity of clinical selection criteria // BMC Cancer. - 2018. - Vol. 18(1). - P. 926.

Iyevleva A.G., Suspitsin E.N., Kroeze K. et al. Non-founder BRCA1 mutations in Russian breast cancer patients // Cancer Lett. - 2010. - Vol. 298. - P. 258-263.

Kast K., Rhiem K., Wappenschmidt B. et al. Prevalence of BRCA1/2 germline mutations in 21 401 families with breast and ovarian cancer // J. Med. Genet. - 2016. -Vol. 53. - P. 465-471.

Kiiski J.I., Pelttari L.M., Khan S. et al. Exome sequencing identifies FANCM as a susceptibility gene for triple-negative breast cancer // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2014. - Vol. 111. - P. 15172-15177.

Kircher M., Witten D.M., Jain P. et al. A general framework for estimating the relative pathogenicity of human genetic variants // Nat Genet. - 2014. - Vol. 46(3). - P. 310-315.

Kuchenbaecker K.B., Hopper J.L., Barnes D.R. et al. Risks of Breast, Ovarian, and Contralateral Breast Cancer for BRCA1 and BRCA2 Mutation Carriers // JAMA. - 2017. - Vol. 317(23). - P. 2402-2416.

LaDuca H., Stuenkel A.J., Dolinsky J.S. et al. Utilization of multigene panels in hereditary cancer predisposition testing: analysis of more than 2, 000 patients // Genet. Med. - 2014. - Vol. 16. - P. 830-837.

Lu H.M., Li S., Black M.H., Lee S. et al. Association of Breast and Ovarian Cancers With Predisposition Genes Identified by Large-Scale Sequencing // JAMA Oncol. -2018. - DOI: 10.1001/jamaoncol.2018.2956

Mainiero M.B., Lourenco A., Mahoney M.C. et al. ACR appropriateness criteria breast cancer screening // J. Am. Coll. Radiol. - 2013. - Vol. 10. - P. 11-14.

Michailidou K., Lindstrom S., Dennis J. et al. Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci // Nature. - 2017. - Vol. 551. - № 7678. - P. 92-94.

NCCN Guidelines Version 2.2019.

Nelson H.D., Pappas M., Zakher B. et al. Risk assessment, genetic counseling, and genetic testing for BRCA-related cancer in women: a systematic review to update the U.S. Preventive Services Task Force recommendation // Ann Intern. Med. - 2014. - Vol. 160. - P. 255-266.

Njiaju U.O., Olopade O.I. Genetic determinants of breast cancer risk: a review of current literature and issues pertaining to clinical application // Breast J. - 2012. - Vol.18. - P. 436-442.

Palacios J., Robles-Frias M.J., Castilla M.A. et al. The molecular pathology of hereditary breast cancer // Patho-biology. - 2008. - Vol. 75(2). - P. 85-94.

Park J.S., Lee S.T., Nam E.J. et al. Variants of cancer susceptibility genes in Korean BRCA1/2 mutation-negative patients with high risk for hereditary breast cancer // BMC Cancer. - 2018. - Vol. 18(1). - P. 83.

Rosenthal E.T., Bernhisel R., Brown K. et al. Clinical testing with a panel of 25 genes associated with increased cancer risk results in a significant increase in clinically significant findings across a broad range of cancer histories // Cancer Genet. - 2017. - Vol. 218-219. - P. 58-68.

Richards S., Aziz N., Bale S. et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology // Genet. Med. - 2015. - Vol. 17. -P. 405-423.

Sokolenko A., Imyanitov E. Multigene testing for breast cancer risk assessment: an illusion of added clinical value // Chin. Clin. Oncol. - 2017. - Vol. 6(2). - P. 15.

Sokolenko A.P., Iyevleva A.G., Preobrazhenskaya E.V. et al. High prevalence and breast cancer predisposing role of the BLM c.1642 C>T (Q548X) mutation in Russia // Int. J. Cancer. - 2012. - Vol. 130. - P. 2867-2873.

Sokolenko A.P., Rozanov M.E., Mitiushkina N.V. et al. Founder mutations in early-onset, familial and bilateral breast cancer patients from Russia // Fam Cancer. -2007. - Vol. 6. - P. 281-286.

Stadler Z.K., Schrader K.A., Vijai J. et al. Cancer genomics and inherited risk // J. Clin. Oncol. - 2014. - Vol. 32(7). - P. 687-698.

Thompson E.R., Doyle M.A., Ryland G.L. et al. Exome sequencing identifies rare deleterious mutations in DNA repair genes FANCC and BLM as potential breast cancer susceptibility alleles // PLoS Genet. - 2012. - Vol. 8. - P. e1002894.

Tung N., Battelli C., Allen B. et al. Frequency of mutations in individuals with breast Cancer referred for BRCA1 and BRCA2 testing using next-generation sequencing with a 25-gene panel // Cancer. - 2015. - Vol. 121(1). - P. 25-33.

Tung N., Domchek S.M., Stadler Z. et al. Counselling framework for moderate-penetrance cancer-susceptibility mutations // Nat. Rev. Clin. Oncol. - 2016. - Vol. 13(9). - P. 581-588.

van den Akker J., Mishne G. et al. A machine learning model to determine the accuracy of variant calls in capture-based next generation sequencing // BMC Genomics. - 2018. - Vol. 19(1). - P. 263.

Лицензия Creative Commons

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.

Copyright (c) 2019 Кирилл Загороднев, Евгений Суспицын, Анна Соколенко, Илья Бизин, Евгений Имянитов, А. Романько, М. Анисимова, Е. Кулигина