Детекция мутаций TP53 в плазме крови больных раком яичника и раком молочной железы
pdf

Ключевые слова

жидкая биопсия
рак молочной железы
рак яичника
мутация

Как цитировать

Иевлева, А., Городнова, Т., Алексахина, С., Анисимова, Е., Гиголаева, Л., Соколенко, А., Загороднев, К., Дмитриев, В., Берлев, И., Криворотько, П., & Имянитов, Е. (2022). Детекция мутаций TP53 в плазме крови больных раком яичника и раком молочной железы. Вопросы онкологии, 67(2), 260–267. https://doi.org/10.37469/0507-3758-2021-67-2-260-267

Аннотация

Актуальность. Анализ циркулирующей опухолевой ДНК предоставляет широкие возможности для контроля результатов лечения онкологических заболеваний. Соматические мутации в гене TP53 присутствуют практически во всех карциномах молочной железы, развившихся у носительниц наследственных мутаций в гене BRCA1, а также в подавляющем большинстве серозных опухолей яичника высокой степени злокачественности, что позволяет использовать их для мониторинга заболевания у пациенток с перечисленными патологиями.

Целью работы стал анализ содержания опухоль-специфических мутаций TP53 в плазме крови пациенток с серозным низкодифференцированным раком яичника (РЯ) и BRCA1-ассоциированным раком молочной железы (РМЖ).

Материалы и методы. Как минимум по одному образцу плазмы было получено от 10 больных РЯ и 7 пациенток с BRCA1-ассоциированным РМЖ. Первичный внутриопухолевый статус гена TP53 определялся в архивном опухолевом материале путем таргетного секвенирования нового поколения. Тестирование образцов плазмы на наличие опухоль-специфических мутаций TP53, и, в одном случае, мутации BRAF V600E, осуществлялось при помощи цифровой капельной ПЦР.

Результаты. При раке яичника во всех 8 образцах циркулирующей ДНК, полученных в момент прогрессирования заболевания, до начала или во время неоадъювантного лечения, были обнаружены мутации TP53. Напротив, 8 образцов плазмы, полученных в период ремиссии, после оперативного лечения или после неоадъювантной химиотерапии, не содержали опухоль-специфических мутаций. При раке молочной железы циркулирующая опухолевая ДНК была выявлена в 2 из 4 образцов, полученных перед лечением, и не детектировалась после окончания терапии или в фазу ремиссии.

Заключение. При раке яичника наблюдается хорошее соответствие между присутствием опухолевой ДНК в циркуляции и клинической картиной заболевания, поэтому тестирование циркулирующей ДНК с мутацией TP53 может использоваться в качестве биомаркера при этом заболевании. При раке молочной железы II-III стадий, в отличие от РЯ, опухолевая ДНК в плазме присутствует в меньших количествах, что затрудняет поиск мутаций TP53 в «жидкой биопсии».

https://doi.org/10.37469/0507-3758-2021-67-2-260-267
pdf

Библиографические ссылки

Barbosa A., Peixoto A., Pinto P. et al. Potential clinical applications of circulating cell-free DNA in ovarian cancer patients. Expert Rev. Mol. Med. 2018; 20:e6. doi: 10.1017/erm.2018.5.

Manié E., Vincent-Salomon A., Lehmann-Che J. et al. High frequency of TP53 mutation in BRCA1 and sporadic basal-like carcinomas but not in BRCA1 luminal breast tumors. Cancer Res. 2009;69(2): 663-671. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-08-1560.

Ahmed A.A., Etemadmoghadam D., Temple J. et al. Driver mutations in TP53 are ubiquitous in high grade serous carcinoma of the ovary. J. Pathol. 2010;221(1):49-56.

Rowlands V., Rutkowski A.J., Meuser E. et al. Optimisation of robust singleplex and multiplex droplet digital PCR assays for high confidence mutation detection in circulating tumour DNA. Sci. Rep. 2019;9(1):12620. doi: 10.1038/s41598-019-49043-x.

Pereira E., Camacho-Vanegas O., Anand S. et al. Personalized Circulating Tumor DNA Biomarkers Dynamically Predict Treatment Response and Survival In Gynecologic Cancers. PLoS One. 2015;10(12):e0145754. doi: 10.1371/journal.pone.0145754.

Parkinson C.A., Gale D., Piskorz A.M. et al. Exploratory Analysis of TP53 Mutations in Circulating Tumour DNA as Biomarkers of Treatment Response for Patients with Relapsed High-Grade Serous Ovarian Carcinoma: A Retrospective Study. PLoS Med. 2016;13(12):e1002198. doi: 10.1371/journal.pmed.1002198.

Kim Y.M., Lee S.W., Lee Y.J. et al. Prospective study of the efficacy and utility of TP53 mutations in circulating tumor DNA as a non-invasive biomarker of treatment response monitoring in patients with high-grade serous ovarian carcinoma. J. Gynecol. Oncol. 2019;30(3):e32. doi: 10.3802/jgo.2019.30.e32.

Vitale S.R., Groenendijk F.H., van Marion R. et al. TP53 Mutations in Serum Circulating Cell-Free Tumor DNA As Longitudinal Biomarker for High-Grade Serous Ovarian Cancer. Biomolecules. 2020;10(3):415. doi: 10.3390/biom10030415.

Noguchi T., Sakai K., Iwahashi N. et al. Changes in the gene mutation profiles of circulating tumor DNA detected using CAPP-Seq in neoadjuvant chemotherapy-treated advanced ovarian cancer. Oncol. Lett. 2020;19(4):2713-2720. doi: 10.3892/ol.2020.11356.

Alimirzaie S., Bagherzadeh M., Akbari M.R. Liquid biopsy in breast cancer: A comprehensive review. Clin. Genet. 2019;95(6): 643-660. doi: 10.1111/cge.13514.

Dawson S.J., Tsui D.W., Murtaza M. et al. Analysis of circulating tumor DNA to monitor metastatic breast cancer. N. Engl. J. Med. 2013;368(13):1199-1209. doi: 10.1056/NEJMoa1213261.

Madic J., Kiialainen A., Bidard F.C. et al. Circulating tumor DNA and circulating tumor cells in metastatic triple negative breast cancer patients. Int. J. Cancer. 2015;136(9):2158-2165. doi: 10.1002/ijc.29265.

Liang D.H., Ensor J.E., Liu Z.B. et al. Cell-free DNA as a molecular tool for monitoring disease progression and response to therapy in breast cancer patients. Breast Cancer Res. Treat. 2016;155(1): 139-149. doi: 10.1007/s10549-015-3635-5.

Nakauchi C., Kagara N., Shimazu K. et al. Detection of TP53/PIK3CA Mutations in Cell-Free Plasma DNA From Metastatic Breast Cancer Patients Using Next Generation Sequencing. Clin. Breast Cancer. 2016;16(5):418-423. doi: 10.1016/j.clbc.2016.05.004.

Rossi G., Mu Z., Rademaker A.W. et al. Cell-Free DNA and Circulating Tumor Cells: Comprehensive Liquid Biopsy Analysis in Advanced Breast Cancer. Clin. Cancer Res. 2018;24(3): 560-568. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-17-2092.

O'Leary B., Hrebien S., Morden J.P. et al. Early circulating tumor DNA dynamics and clonal selection with palbociclib and fulvestrant for breast cancer. Nat. Commun. 2018;9(1):896. doi: 10.1038/s41467-018-03215-x.

Armbruster D.A., Pry T. Limit of blank, limit of detection and limit of quantitation. Clin. Biochem. Rev. 2008;29 Suppl 1(Suppl 1): S49-52.

Riva F., Bidard F.C., Houy A. et al. Patient-Specific Circulating Tumor DNA Detection during Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer. Clin. Chem. 2017;63(3): 691-699. doi: 10.1373/clinchem.2016.262337.

McDonald B.R., Contente-Cuomo T., Sammut S.J. et al. Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer. Sci. Transl. Med. 2019;11(504): pii: eaax7392. doi: 10.1126/scitranslmed.aax7392.

Butler T.M., Boniface C.T., Johnson-Camacho K. et al. Circulating tumor DNA dynamics using patient-customized assays are associated with outcome in neoadjuvantly treated breast cancer. Cold Spring Harb. Mol. Case Stud. 2019;5(2):pii: a003772. doi: 10.1101/mcs.a003772.

Rothé F., Silva M.J., Venet D. et al. Circulating Tumor DNA in HER2-Amplified Breast Cancer: A Translational Research Substudy of the NeoALTTO Phase III Trial. Clin. Cancer Res. 2019;25(12): 3581-3588. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-2521.

Garcia-Murillas I., Chopra N., Comino-Méndez I. et al. Assessment of Molecular Relapse Detection in Early-Stage Breast Cancer. JAMA Oncol. 2019. doi: 10.1001/jamaoncol.2019.1838.

Stover D.G., Parsons H.A., Ha G. et al. Association of Cell-Free DNA Tumor Fraction and Somatic Copy Number Alterations With Survival in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer. J. Clin. Oncol. 2018;36(6): 543-553. doi: 10.1200/JCO.2017.76.0033.

Beddowes E., Sammut S.J., Gao M., Caldas C. Predicting treatment resistance and relapse through circulating DNA. Breast. 2017;34 Suppl 1:S31-S35. doi: 10.1016/j.breast.2017.06.024.

Лицензия Creative Commons

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.

© АННМО «Вопросы онкологии», Copyright (c) 2021